3月16日，河南農(nóng)業(yè)大學康相濤教授團隊基于前期雞泛基因組研究成果與公共數(shù)據(jù)，開發(fā)了適用于我國地方雞基因組系列液相芯片——“神農(nóng)1號”。該系列芯片的成功研發(fā)，搭建了用于地方雞種質(zhì)資源鑒定、精準評價、保護與開發(fā)利用的高效技術平臺，對我國家禽種業(yè)振興與可持續(xù)發(fā)展具有重要的意義。

58個地方雞品種地理分布

該系列芯片采用模塊組合的設計思路：模塊I是利用66.5M泛基因組序列，設計5K標記；模塊II是整合生長、繁殖、屠體等性狀GWAS的功能位點，設計5K標記；模塊III是整合我國58個地方雞種中高頻SNP位點，設計30K標記；模塊IV是整合生長、羽色等性狀的原因InDel、SV、PAV突變位點。集成上述模塊，創(chuàng)制了40K、5K地方雞基因組系列芯片——“神農(nóng)1號”。

“神農(nóng)1號”40K地方雞基因組芯片位點分布

“神農(nóng)1號”地方雞基因組液相芯片試劑盒

河南農(nóng)業(yè)大學家禽團隊是教育部、農(nóng)業(yè)部科研創(chuàng)新團隊?，F(xiàn)有16名骨干成員，其中教授9人、副教授3人。團隊帶頭人康相濤教授先后榮獲全國先進工作者、中華農(nóng)業(yè)英才獎和首屆國際種業(yè)科學家獎等。團隊長期圍繞地方雞種質(zhì)資源保護和利用開展研究，先后主持承擔國家“863”計劃、國家自然科學基金、神農(nóng)種業(yè)實驗室“一流課題”項目等國家和省部級科研項目；主持培育國審新品種2個，完成的《中國地方雞種質(zhì)資源優(yōu)異性狀發(fā)掘創(chuàng)新與應用》獲國家技術發(fā)明獎二等獎、《地方雞保護利用技術體系創(chuàng)建與應用》獲國家科學技術進步獎二等獎，授權(quán)國家發(fā)明專利46項，制定國家和地方標準10項，發(fā)表中英文論文500余篇。

上述研究成果的取得主要依托于神農(nóng)種業(yè)實驗室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部畜禽資源（家禽）評價利用重點實驗室、河南省雞種質(zhì)資源創(chuàng)新與利用重點實驗室、河南省家禽育種國際聯(lián)合實驗室和河南省家禽種質(zhì)資源創(chuàng)新工程研究中心等省部級研究平臺，以及保存了29個特色資源、設施設備一流的河南農(nóng)業(yè)大學家禽種質(zhì)資源場。

參考文獻

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