日前，筆者從河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉，該院畜牧研究所與北京康普森農(nóng)業(yè)科技有限公司合作，成功研發(fā)出具有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的河南首個地方肉牛芯片“豫牛一號”。該芯片不但可用于肉牛全基因組選擇育種、重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因挖掘，還可用于河南本地肉牛品種遺傳特性解析、品種鑒定、資源保護(hù)等工作。
河南目前有南陽牛、郟縣紅牛、夏南牛、皮南牛、德南牛5個肉牛種源，它們具有體軀高大、肌肉發(fā)達(dá)、體質(zhì)結(jié)實(shí)、肉質(zhì)細(xì)膩等優(yōu)質(zhì)特性，蘊(yùn)藏著寶貴的遺傳基因。然而，由于缺乏有效的鑒定和評價手段，這些珍貴的資源難以得到充分保護(hù)和利用。傳統(tǒng)的肉牛育種方法主要依賴于表型選擇，效率低、周期長?；蛐酒夹g(shù)能夠快速、準(zhǔn)確地檢測出肉牛與重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的基因，從而加速優(yōu)良品種的選育進(jìn)程。
“豫牛一號”的開發(fā)是利用5個肉牛種源重測序數(shù)據(jù)，在全基因組中挖掘高檢出率、高M(jìn)AF、基因組均勻分布的SNP位點(diǎn)41580個，同時基于肉牛通用芯片功能位點(diǎn)，將已發(fā)表的世界優(yōu)良牛種與生長、抗病、毛色、飼料轉(zhuǎn)換率等14個性狀顯著關(guān)聯(lián)的8420個SNP分子標(biāo)記納入“豫牛一號”，共計5萬個SNP位點(diǎn)。
國家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位專家、河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院研究員王二耀說，通過對剛出生小牛的血液或毛囊DNA進(jìn)行提取，使用“豫牛一號”芯片檢測，就可以預(yù)測小牛身體的各項(xiàng)潛能。
該芯片研發(fā)團(tuán)隊成員、河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院副研究員張子敬介紹，該芯片平均檢出率可達(dá)99.3%，重復(fù)樣本分型一致率達(dá)99.8%，具有基因組覆蓋全面、檢測成本低、分型效果好、分型準(zhǔn)確率高等特點(diǎn)。
“‘豫牛一號’的開發(fā)利用將進(jìn)一步促進(jìn)河南中原牛、皮南牛、德南牛等新品種選育提升，為河南畜禽種業(yè)振興、破解‘卡脖子’問題提供科技支撐?！焙幽鲜∪馀．a(chǎn)業(yè)技術(shù)體系首席專家閆祥洲說。
（作者：于濤）
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