二是進一步加大違規(guī)懲罰力度。明確將申請人被列入嚴重違法失信企業(yè)名單的納入不予受理、不予注冊的情形；加嚴“涂改、倒賣、出租、出借、轉讓”嬰配注冊證書的懲罰措施。

三是進一步落實“放管服”要求。落實企業(yè)主體責任，經(jīng)集團充分評估后，集團母公司及其全資子公司間均可配方調用；將申請企業(yè)名稱、生產(chǎn)地址名稱（非實際地址）變更的審評審批調整為“當場核實后予以變更”；將檢驗時限從30個工作日壓縮到20個工作日；增加電子證書的法律效力；簡化工作流程，取消復審環(huán)節(jié)。

四是進一步明確職責程序和時限。明確食品審評機構負責配方注冊申請的受理、審評工作，可組織食品安全、食品加工、營養(yǎng)和臨床醫(yī)學等領域專家進行論證；明確核查機構現(xiàn)場核查環(huán)節(jié)有關程序和時限。

五是調整職能部門名稱和文字表述。如將“食藥總局”統(tǒng)一修訂為“市場監(jiān)督管理總局”；申請材料的要求統(tǒng)一到申請材料部分。

另外，值得注意的是，修訂版征求意見稿在第十九條中還首次明確了7種不予注冊的情形，并將申請人被列入嚴重違法失信企業(yè)名單的納入不予受理、不予注冊的情形。

第十九條 有下列情形之一的，國家市場監(jiān)督管理總局應當作出不予注冊的決定：

（一）申請人不具備與所申請注冊的配方產(chǎn)品相適應的研發(fā)能力、生產(chǎn)能力或檢驗能力；

（二）注冊申請材料不支持產(chǎn)品配方科學性、安全性或依據(jù)不充足；申請材料內(nèi)容矛盾、不真實，不符合法律法規(guī)和食品安全國家標準的；未在規(guī)定時限內(nèi)提交補正材料或者提供的補正材料不符合要求的；

（三）申請人逾期不能確認現(xiàn)場核查，拒絕或者不配合現(xiàn)場核查；現(xiàn)場核查認為申請材料不真實、不一致、無法溯源復現(xiàn)或者存在重大缺陷等問題；未按時完成整改的；

（四）申請人拒絕或者不配合抽樣檢驗；產(chǎn)品檢驗報告不合格；檢驗結果論證表明測定方法不科學、無法復現(xiàn)的；

（五）同一企業(yè)申請注冊的產(chǎn)品配方與其同年齡段已申請產(chǎn)品配方之間沒有明顯差異的；

（六）申請人被列入嚴重違法失信企業(yè)名單的；

（七）其他不符合注冊要求的情形。